風扇頁片拋光機的使用對環境有較高的要求，所以在使用前一定要對環境進行檢查以免發生危險。拋光區域不能長于電源線長度，當拋光墊上粘有灰塵、污垢時要及時進行清洗，如果實在清洗不干凈要及時更換新的拋光墊，無論是安裝還是更換拋光墊都必須在切斷電源的情況下進行。拋光墊下如果有雜物或者紗繩之類物品會增加阻力容易導致皮帶斷裂，因此也要經常進行檢查清理。操作人員要穿好安全防護服裝，在工作時不能將電源線纏入拋光頭里面或者踩住電源線，手腳一定要遠離正在高速旋轉的拋光頭以免發生危險。
風扇頁片拋光機操作的關鍵是要設法得到最大的拋光速率，以便盡快除去磨光時產生的損傷層。同時也要使拋光損傷層不會影響最終觀察到的組織，即不會造成假組織。前者要求使用較粗的磨料，以保證有較大的拋光速率來去除磨光的損傷層，但拋光損傷層也較深；后者要求使用最細的材料，使拋光損傷層較淺，但拋光速率低。
風扇頁片拋光機如何解決這個矛盾的最好的辦法就是把拋光分為兩個階段進行。粗拋目的是去除磨光損傷層，這一階段應具有最大的拋光速率，粗拋形成的表層損傷是次要的考慮，不過也應當盡可能??；其次是精拋(或稱終拋)，其目的是去除粗拋產生的表層損傷，使拋光損傷減到最小。